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SFR Interactions Cellulaires et Applications Thérapeutiques 2

Séparés par des virgules

Les Friday Seminars, c'est quoi ?

Venez nombreux assister au Friday Seminar !

Ces présentations orales durant la pause du midi le vendredi sont l'occasion de mettre à l'honneur les avancées majeures des équipes de recherche Angevines ou des plateformes de la SFR ICAT.
Chaque Friday Seminar, un laboratoire attaché à la SFR ICAT donne la parole à un collaborateur pour exposer ses travaux de recherche ou à l'un de ses chercheurs, ingénieurs ou étudiants. 

Une occasion en or pour découvrir la recherche du pôle Angevin, pour échanger autour de diverses thématiques de recherche et rencontrer des personnalités extérieures qui font la recherche de demain !

Prochain séminaire :

La thérapie photodynamique anti-cancéreuse : de la paillasse au lit du patient

Date : Vendredi 21 juin 2024

Lieu : amphithéathre IBS salle conférence RDC     Horaire : 12h 

Dr Céline Frochot

Directrice de Recherche CNRS, Laboratoire Réactions et Génie des Procédés UMR 7274, Université de Lorraine 

La thérapie photodynamique anti-cancéreuse : de la paillasse au lit du patient

La thérapie photodynamique anticancéreuse ou PDT est une méthode de destruction de cellules cancéreuses. Le principe de la PDT est de faire agir de la lumière sur une molécule photoactivable (encore appelé photosensibilisateur), qui va activer l’oxygène autour d’elle pour produire des espèces réactives de l’oxygène qui vont détruire les cellules tumorales. Les premiers essais sur l’homme ont eu lieu en 1978 et la première autorisation pour un photosensibilisateur a été obtenue en 1993. Depuis, de nombreux essais cliniques ont été menés, dont 30 en France. La PDT est utilisée quotidiennement par les dermatologues en particulier pour traiter des lésions précancéreuses de la peau appelées kératoses actiniques.. Nous verrons, dans cet exposé, les dernières avancées du point de vue recherche fondamentale et du point de vue clinique. 

Référence : Frochot C., Mordon S., Update of the situation of clinical photodynamic therapy in Europe in the 2003-2018 period, Journal of Porphyrins and Phthalocyanines, 23(4-5), 347-357 (2019). 

 Celine.Frochot @ univ-lorraine.fr

Séminaires précédents :

Avancées de l’analyse protéomique et prochains challenges

Date : Vendredi 17 mai 2024

Lieu : amphithéathre ICO     Horaire : 12h 

Dr François Guillonneau 

Chargé de recherche à l'Institut de Cancérologie de l'Ouest (ICO) et coresponsable de l'équipe Oncoprotéomique et manager opérationnel de la plateforme Prot'ICO 

Avancées de l’analyse protéomique et prochains challenges 

L’analyse protéomique par spectrométrie de masse a pris racine en biologie il y a près de 30 ans et a suscité des espoirs souvent déçus par la trop faible « profondeur » de l’analyse en regard du temps mobilisé, et de la quantité de matériel biologique nécessaires. Je vous propose un regard neuf et démontrerai que les choses ont beaucoup changé… et que de nouveau challenges se profilent. 

Francois.Guillonneau@ico.unicancer.fr 

Mitochondria and neuromuscular disease

Date : Vendredi 15 février 2024

Lieu : Salle de conférence RDC IRIS1     Horaire : 13h 

Amy Vincent 

Wellcome Centre for Mitochondrial Research, Translational and Clinical Research Institute, Faculty of Medical Sciences, Newcastle University 

Mitochondria and neuromuscular disease 

In mitochondrial myopathy mtDNA mutations which are either inherited or sporadic accumulate with age and interrupt the muscles ability to generate ATP via oxidative phosphorylation. Our recent work has looked to understand how mtDNA deletions accumulate within skeletal muscle fibres, how cells respond to the mitochondrial dysfunction associated with mtDNA deletions and the interation between mitochondrial function and skeletal muscle cells. We are also looking to understand the changes in mitochondrial disease patient muscles over time and how this relates to progression of muscle symptoms and the molecular changes associated with resistance exercise in mitochondrial myopathy and myotonic dystrophy. By understanding the molecular mechanisms, changes over time and effects of interventions we hope to identify potential therapeutic taregts. 

amy.vincent@ncl.ac.uk 

Role of inflammasome during Aspergillus fumigatus infection

Date : Vendredi 19 janvier 2024

Lieu : Amphithéatre ICO            Horaire : 12h 

Benoit Briard

CEPR-INSERM Tours 

Role of inflammasome during Aspergillus fumigatus infection 

Invasive fungal infections are recognized as a global public health issue. Collectively, they are responsible for over a million deaths a year. Aspergillus fumigatus is one of the fungal pathogens responsible for a multitude of infections and pathologies, from the allergy to the more dramatic form of pulmonary invasive aspergillosis. 

The innate immune system has developed effective anti-infectious strategies. It recognizes danger signals and engages a cellular and physiological response to maintain homeostasis. The inflammasome is one of the main mechanisms of the innate immune system, with crucial roles in fighting infection. There are several types of inflammasome; these are multimeric protein platforms that lead to inflammatory activation of caspase-1, which in turn results in proteolytic maturation of the pro-inflammatory cytokines IL-1β and IL-18. At the same time, activated caspase-1 also induces cleavage and activation of the gasdermin-D protein, which forms pores in the plasma membrane leading to lytic cell death called pyroptosis and facilitates extracellular release of IL-1β and IL-18. 

Infection with A. fumigatus leads to activation of the inflammasome, which is required for host resistance to infection. We investigated the molecular mechanisms by which the host controls inflammasome activation during A. fumigatus infection, and the fungal motifs (Pathogen-Associated Molecular Patterns, PAMPs) responsible for this activation. We describe the essential role of the inflammasome in response to fungal infection. 

However, today, A. fumigatus infections are described as secondary superinfections in patients with respiratory comorbidities, often resulting from chronic bacterial infections (as seen in patients with cystic fibrosis) or viral pneumonias (caused by influenza or COVID-19 infections). Currently, we are investigating the regulatory mechanisms and functions of the inflammasome, along with the associated mechanisms during fungal superinfections. Furthermore, we are exploring the potential benefits and harms of this heightened inflammatory response. 

Le poisson zèbre : un modèle pertinent pour l’étude des maladies neurodéveloppementales

Date : Vendredi 24 novembre 2023

Lieu : Amphithéatre ICO            Horaire : 12h 

Dr Elodie Richard

Unité des Mécanismes Moléculaires dans les Démences Neurodégénératives (MMDN),  INSERM U1198, Université de Montpellier 

Le poisson zèbre : un modèle pertinent pour l’étude des maladies neurodéveloppementales.

Avec l’émergence des techniques de séquençage à haut débit, un grand nombre de nouveaux gènes et de variants sont identifiés comme causes génétiques de maladies neurodéveloppementales. Afin de valider la pathogénicité de ces variants et/ou gènes, de comprendre les mécanismes moléculaires à l’origine de ces maladies mais également de mettre en place des stratégies thérapeutiques, nous utilisons, au sein du laboratoire MMDN (Mécanismes Moléculaires des Démences Neurodégénératives), le modèle poisson zèbre. Au moyen de deux études en cours au laboratoire, j’illustrerai l’importance de ce modèle animal pour répondre aux problématiques scientifiques que posent les maladies neurodéveloppementales et neurodégénératives.

L’alliance d’universités européennes EU GREEN : qu’est ce que c’est, qu’en attendre en termes de recherche ?

Date : Vendredi 20 octobre 2023

Lieu : Amphithéatre ICO            Horaire : 12h 

Catherine Passirani – Vice-présidente International et Egalité
Claire Manceau – Responsable du pôle Cap Europe

Direction de l’International, Université d’Angers

L’alliance d’universités européennes EU GREEN : qu’est ce que c’est, qu’en attendre en termes de recherche ? 

50 Alliances d’universités européennes ont été sélectionnées entre 2019 et 2023 par la Commission européenne. L’Université d’Angers est engagée dans l’une d’entre elles avec huit autres partenaires européens « EU GREEN : European Universities alliance for sustainability : GRowth, inclusive Education and EnviroNment ». 
L’objectif de ces alliances est « d’inventer l’université du futur grâce une stratégie de formation et de recherche commune d'excellence ». Les 9 universités d’EU GREEN se sont accordées pour mettre la durabilité au cœur de l’ensemble de leurs missions (formation, recherche, innovation, service à la société) et ont défini un planning d’activités et d’actions concrètes à entreprendre. 
Le projet a démarré officiellement le 1er janvier 2023 mais au-delà des quatre ans du financement européen obtenu, l’ambition des neuf recteurs est bien de créer des partenariats forts et durables. Plusieurs lots de travail ont été définis : l’un d’eux porte sur la recherche et comment développer les collaborations en recherche entre nos 9 universités. L’UA coordonne les actions de ce lot de travail, plusieurs appels à projets ont été lancés dernièrement à destination de l’ensemble des enseignants-chercheurs de nos universités et de nouvelles actions vont continuer à se mettre en place. 
Lors de cette intervention, le contenu de ce lot de travail vous sera présenté et nous échangerons sur les possibilités de rejoindre les actions en cours. 

What you need to know to start transcriptome sequencing ?

Date : Vendredi 29 septembre 2023

Lieu : Visioconférence            Horaire : 12h 

Lien vers la réunion visio 

Dr Abderahim Gaceb

PhD Regional Account Manager, Biomarker Technologies (BMKGENE) Münster, Germany

What you need to know to start transcriptome sequencing?

The aim of the seminar is to provide participants with essential knowledge and practical guidance on the fundamental aspects of transcriptome sequencing. To equip researchers, particularly those new to the field, with the necessary understanding of the underlying principles, methodologies, and considerations involved in transcriptome sequencing. It will cover topics such as sample preparation, library construction, sequencing platforms, data analysis, and interpretation of transcriptomic data. By the end of the seminar, participants will have gained valuable insights into the key steps and best practices for initiating transcriptome sequencing experiments, empowering them to confidently embark on their own transcriptomic research projects.  

 In this seminar (in French), you will be learning about:  

Basics and principles of transcriptome sequencing technologies (NGS and TGS)  

  1. What you need to know before an mRNA Sequencing Experiment  
  2. Snapshot of mRNAseq, Single-cell, Single-nuclei RNAseq and spatial transcriptomics 
  3. NGS and TGS-based eukaryotic mRNA sequencing workflow  
  4. Transcriptome Data Interpretation: What you can expect from the data  

Exploring mitochondrial functions and their interplay with the cell cycle: from super-resolution microscopy to FRET biosensors.

Date : Vendredi 30 juin 2023

Lieu : Amphithéatre ICO            Horaire : 12h 

Dr Giulia Bertolin 

Laboratoire : Team "Microscopy for Cell Biosensing”, Institute of Genetics and Development of Rennes (IGDR), UMR 6290 CNRS - University of Rennes 1 

Exploring mitochondrial functions and their interplay with the cell cycle: from super-resolution microscopy to FRET biosensors.

Mitochondria are signaling hubs key for cell physiology, and mitochondrial dysfunctions are often retrieved in multifaceted disorders such as cancer and neurodegenerative diseases. At the molecular level, mitochondria are perfectly integrated with other subcellular compartments and machineries. For instance, functions such as mitochondrial morphology and ATP productions were reported to change according to the cell cycle phase of the cell. However, our view on how the cell cycle machinery can directly shape mitochondrial activities is still fragmentary.  

In my talk, I will cover how the cell cycle protein Aurora kinase A/AURKA directly impacts mitochondrial morphology, the turnover of defective mitochondria by mitophagy and mitochondrial ATP production by interacting with key organelle substrates. These findings benefited from a wide range of quantitative fluorescence microscopy approaches, spanning from super-resolution microscopy to the use of a custom-made FRET biosensor sensing AURKA activation. 

Then, I will showcase how our pipelines to build and analyze the output of genetically-encoded fluorescent probes allowed us to develop the LC3B FRET biosensor, a novel tool to follow autophagy with an unprecedented spatiotemporal precision. With this tool, we elucidated the impact of the cell cycle protein CDK1 in regulating autophagy. 

Together, I will highlight how the use of fluorescence microscopy paves the way for a better understanding of mitochondrial functions, and show how the cell cycle is a key element regulating the multiple activities of this organelle. 

La pharmacogénétique dans le traitement de la colite ulcéreuse : un modèle de découverte et d’application clinique

Date : vendredi 02 juin 2023

Lieu : Amphithéâtre ICO     Horaire : 13h (attention : horaire inhabituel)

Karine TREMBLAY

Laboratoires :  Département de pharmacologie-physiologie, Faculté de médecine et des sciences de la santé, Université de Sherbrooke, Site Saguenay (Chicoutimi, QC, Canada), Laboratoire de recherche et transfert en pharmacogénétique

La pharmacogénétique dans le traitement de la colite ulcéreuse : un modèle de découverte et d’application clinique

Les intérêts de recherche de la Pre Tremblay sont orientés sur l'étude des variants génétiques de la réponse aux médicaments ainsi que sur le transfert des connaissances acquises en pratiques cliniques communautaires (en soins primaires ou en cliniques spécialisées) pour le bénéfice des cliniciens et des patients. Le but étant de favoriser le développement d'outils efficaces qui permettront le déploiement des promesses de la médecine de précision de demain. Que ce soit en diminuant le temps nécessaire pour identifier la dose optimale ou éviter les effets indésirables, les individus et la société en retireront un bénéfice concret. Plusieurs projets sont en cours dans son laboratoire. Lors de la conférence, elle présentera un survol de sa programmation de recherche et mettra en lumière son projet de recherche sur l’étude des déterminants pharmacogénétiques de la colite ulcéreuse.

Présentation de la SFR QuaSaV, Qualité et Santé du Végétal et des unités de la SFR

Date : Vendredi 26 mai 2023

Lieu : RDC IRIS1 - IBS           Horaire : 12h 

Fabrice Foucher, Valérie Raymond et Pascal Poupard 

Présentation de la SFR QuaSaV, Qualité et Santé du Végétal et des unités de la SFR

  • Axes de recherche
  • Plateaux mutualisés et plateformes
  • Animation scientifique
  • Unités de recherche membres de la SFR. 

A la marge des sciences institutionnelles, philosophie et anthropologie de l'éthique du mouvement de biohacking en France

Date : vendredi 05 mai 2023

Lieu : Amphithéâtre ICO     Horaire : 12h 

Guillaume Bagnolini (Docteur en philosophie des sciences)

Laboratoires : Laboratoire Interdisciplinaire Sciences Innovations Sociétés (LISIS), Université Paris-Est Marne-la-Vallée 

A la marge des sciences institutionnelles, philosophie et anthropologie de l'éthique du mouvement de biohacking en France

Le biohacking est une vive critique contre les institutions scientifiques officielles et un appel à plus de liberté à travers notamment la constitution de laboratoires citoyens « indépendants », les biohackerspaces. Mon étude philosophique et anthropologique s’est basée essentiellement sur un laboratoire citoyen, la Myne à Lyon. Après une partie historique décrivant et analysant les influences épistémologiques dont s’inspire le biohacking, je me suis posé plusieurs questions : en quoi la pratique du bricolage technique et scientifique réalisée dans ces espaces, amène à construire de « nouvelles » normes et valeurs morales ? Comment se construit l’éthique collective au sein d’un espace tel que la Myne ? Comment les valeurs morales défendues sont opérationnalisées sur le terrain ? Comment s’articule la construction d’une éthique collective avec l’ensemble des éthiques individuelles au cours du temps ? L’objectif de ce travail, à travers l’analyse critique de ce mouvement, est de conduire à une réflexion plus large sur la participation citoyenne dans les choix technoscientifiques et sur les politiques de production scientifique et technique.

Combining flow cytometry & particle analysis to meet the challenges of the nano-scale

Date : mercredi 29 mars 2023

Lieu : Amphithéâtre ICO     Horaire : 12h 

Natalia Gebara (Application Scientist)

Laboratoires : société NanoFCM 

Combining flow cytometry & particle analysis to meet the challenges of the nano-scale

Single particle characterisation has become increasingly relevant for research into particles at the nanoscale, progressing from bulk analysis techniques and Gen-1 particle analysis to comprehensive multi-parameter measurements such as Nano-flow cytometry. Nano-flow utilizes instrumentation specifically designed for Nano-particle analysis allowing for 1000’s of NPs to be characterized per minute both with and without the use of staining techniques. High resolution side scatter detection allows for size and concentration to be determined for all biological particles >40nm, whilst simultaneous fluorescence detection identifies the presence or labelled markers and targets of interest. 
This seminar is appropriate for any research group looking to analyse particles at the nanoscale (>40-1000nm). For example, appropriate particle types include EVs, LNPs and viruses/ virus-like particles. Other nanomaterials, such as AuNPs , are also suitable– their greater density means we can detect down to >8nm on side scatter. 

Natalia Gebara, PhD  
Application Scientist, Natalia.Gebara @ nanofcm.com 

Cette présentation est adossée à la réunion scientifique du GO-EV qui se tiendra sur la matinée, mais est bien entendu ouverte à toutes les personnes du site santé qui souhaite y assister. Une démonstration technique de l’appareillage sera donné dans les locaux de PACeM l’après-midi (14h30-16h30) organisé par Catherine Guillet. Si des personnes souhaitent tester des échantillons, merci de les inviter à se rapprocher de Catherine (catherine.guillet @ univ-angers.fr).

Save the date

  • 15 février : Amy VINCENT invitée par MitoVasc - MitoLab
  • 19 mars (matinée suivie d’un cocktail) : Séminaire commun Confluences ICAT
  • 22 mars : Oksana KRUPKA de MINT
  • 12 avril : Kévin LE DIVELLEC invité par MINT 
  • 17 mai: François GUILLONNEAU invité par la SFR ICAT
  • 21 juin : Céline FROCHOT invitée par MINT
  • 28 juin : Danielle ARRUDA invitée par GLIAD
  • 5 juillet : Alexandre CECALDI invité pour le Workshop Nanomed
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