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Les Friday Seminars, c'est quoi ?
Venez nombreux assister au Friday Seminar !
Ces présentations orales durant la pause du midi le vendredi sont l'occasion de mettre à l'honneur les avancées majeures des équipes de recherche Angevines ou des plateformes de la SFR ICAT.
Chaque Friday Seminar, un laboratoire attaché à la SFR ICAT donne la parole à un collaborateur pour exposer ses travaux de recherche ou à l'un de ses chercheurs, ingénieurs ou étudiants.
Une occasion en or pour découvrir la recherche du pôle Angevin, pour échanger autour de diverses thématiques de recherche et rencontrer des personnalités extérieures qui font la recherche de demain !
Prochain séminaire :
Mitochondria and neuromuscular disease
Le 15 février 2024
Date : Vendredi 15 février 2024
Lieu : Salle de conférence RDC IRIS1 Horaire : 13h
Amy Vincent
Wellcome Centre for Mitochondrial Research, Translational and Clinical Research Institute, Faculty of Medical Sciences, Newcastle University
Mitochondria and neuromuscular disease
In mitochondrial myopathy mtDNA mutations which are either inherited or sporadic accumulate with age and interrupt the muscles ability to generate ATP via oxidative phosphorylation. Our recent work has looked to understand how mtDNA deletions accumulate within skeletal muscle fibres, how cells respond to the mitochondrial dysfunction associated with mtDNA deletions and the interation between mitochondrial function and skeletal muscle cells. We are also looking to understand the changes in mitochondrial disease patient muscles over time and how this relates to progression of muscle symptoms and the molecular changes associated with resistance exercise in mitochondrial myopathy and myotonic dystrophy. By understanding the molecular mechanisms, changes over time and effects of interventions we hope to identify potential therapeutic taregts.
amy.vincent@ncl.ac.uk
Séminaires précédents :
Role of inflammasome during Aspergillus fumigatus infection
Le 19 janvier 2024
Date : Vendredi 19 janvier 2024
Lieu : Amphithéatre ICO Horaire : 12h
Benoit Briard
CEPR-INSERM Tours
Role of inflammasome during Aspergillus fumigatus infection
Invasive fungal infections are recognized as a global public health issue. Collectively, they are responsible for over a million deaths a year. Aspergillus fumigatus is one of the fungal pathogens responsible for a multitude of infections and pathologies, from the allergy to the more dramatic form of pulmonary invasive aspergillosis.
The innate immune system has developed effective anti-infectious strategies. It recognizes danger signals and engages a cellular and physiological response to maintain homeostasis. The inflammasome is one of the main mechanisms of the innate immune system, with crucial roles in fighting infection. There are several types of inflammasome; these are multimeric protein platforms that lead to inflammatory activation of caspase-1, which in turn results in proteolytic maturation of the pro-inflammatory cytokines IL-1β and IL-18. At the same time, activated caspase-1 also induces cleavage and activation of the gasdermin-D protein, which forms pores in the plasma membrane leading to lytic cell death called pyroptosis and facilitates extracellular release of IL-1β and IL-18.
Infection with A. fumigatus leads to activation of the inflammasome, which is required for host resistance to infection. We investigated the molecular mechanisms by which the host controls inflammasome activation during A. fumigatus infection, and the fungal motifs (Pathogen-Associated Molecular Patterns, PAMPs) responsible for this activation. We describe the essential role of the inflammasome in response to fungal infection.
However, today, A. fumigatus infections are described as secondary superinfections in patients with respiratory comorbidities, often resulting from chronic bacterial infections (as seen in patients with cystic fibrosis) or viral pneumonias (caused by influenza or COVID-19 infections). Currently, we are investigating the regulatory mechanisms and functions of the inflammasome, along with the associated mechanisms during fungal superinfections. Furthermore, we are exploring the potential benefits and harms of this heightened inflammatory response.
Le poisson zèbre : un modèle pertinent pour l’étude des maladies neurodéveloppementales
Le 24 novembre 2023
Date : Vendredi 24 novembre 2023
Lieu : Amphithéatre ICO Horaire : 12h
Dr Elodie Richard
Unité des Mécanismes Moléculaires dans les Démences Neurodégénératives (MMDN), INSERM U1198, Université de Montpellier
Le poisson zèbre : un modèle pertinent pour l’étude des maladies neurodéveloppementales.
Avec l’émergence des techniques de séquençage à haut débit, un grand nombre de nouveaux gènes et de variants sont identifiés comme causes génétiques de maladies neurodéveloppementales. Afin de valider la pathogénicité de ces variants et/ou gènes, de comprendre les mécanismes moléculaires à l’origine de ces maladies mais également de mettre en place des stratégies thérapeutiques, nous utilisons, au sein du laboratoire MMDN (Mécanismes Moléculaires des Démences Neurodégénératives), le modèle poisson zèbre. Au moyen de deux études en cours au laboratoire, j’illustrerai l’importance de ce modèle animal pour répondre aux problématiques scientifiques que posent les maladies neurodéveloppementales et neurodégénératives.
L’alliance d’universités européennes EU GREEN : qu’est ce que c’est, qu’en attendre en termes de recherche ?
Le 20 octobre 2023
Date : Vendredi 20 octobre 2023
Lieu : Amphithéatre ICO Horaire : 12h
Catherine Passirani – Vice-présidente International et Egalité
Claire Manceau – Responsable du pôle Cap Europe
Direction de l’International, Université d’Angers
L’alliance d’universités européennes EU GREEN : qu’est ce que c’est, qu’en attendre en termes de recherche ?
50 Alliances d’universités européennes ont été sélectionnées entre 2019 et 2023 par la Commission européenne. L’Université d’Angers est engagée dans l’une d’entre elles avec huit autres partenaires européens « EU GREEN : European Universities alliance for sustainability : GRowth, inclusive Education and EnviroNment ».
L’objectif de ces alliances est « d’inventer l’université du futur grâce une stratégie de formation et de recherche commune d'excellence ». Les 9 universités d’EU GREEN se sont accordées pour mettre la durabilité au cœur de l’ensemble de leurs missions (formation, recherche, innovation, service à la société) et ont défini un planning d’activités et d’actions concrètes à entreprendre.
Le projet a démarré officiellement le 1er janvier 2023 mais au-delà des quatre ans du financement européen obtenu, l’ambition des neuf recteurs est bien de créer des partenariats forts et durables. Plusieurs lots de travail ont été définis : l’un d’eux porte sur la recherche et comment développer les collaborations en recherche entre nos 9 universités. L’UA coordonne les actions de ce lot de travail, plusieurs appels à projets ont été lancés dernièrement à destination de l’ensemble des enseignants-chercheurs de nos universités et de nouvelles actions vont continuer à se mettre en place.
Lors de cette intervention, le contenu de ce lot de travail vous sera présenté et nous échangerons sur les possibilités de rejoindre les actions en cours.
What you need to know to start transcriptome sequencing ?
Le 29 septembre 2023
Date : Vendredi 29 septembre 2023
Lieu : Visioconférence Horaire : 12h
Dr Abderahim Gaceb
PhD Regional Account Manager, Biomarker Technologies (BMKGENE) Münster, Germany
What you need to know to start transcriptome sequencing?
The aim of the seminar is to provide participants with essential knowledge and practical guidance on the fundamental aspects of transcriptome sequencing. To equip researchers, particularly those new to the field, with the necessary understanding of the underlying principles, methodologies, and considerations involved in transcriptome sequencing. It will cover topics such as sample preparation, library construction, sequencing platforms, data analysis, and interpretation of transcriptomic data. By the end of the seminar, participants will have gained valuable insights into the key steps and best practices for initiating transcriptome sequencing experiments, empowering them to confidently embark on their own transcriptomic research projects.
In this seminar (in French), you will be learning about:
Basics and principles of transcriptome sequencing technologies (NGS and TGS)
- What you need to know before an mRNA Sequencing Experiment
- Snapshot of mRNAseq, Single-cell, Single-nuclei RNAseq and spatial transcriptomics
- NGS and TGS-based eukaryotic mRNA sequencing workflow
- Transcriptome Data Interpretation: What you can expect from the data
Exploring mitochondrial functions and their interplay with the cell cycle: from super-resolution microscopy to FRET biosensors.
Le 30 juin 2023
Date : Vendredi 30 juin 2023
Lieu : Amphithéatre ICO Horaire : 12h
Dr Giulia Bertolin
Laboratoire : Team "Microscopy for Cell Biosensing”, Institute of Genetics and Development of Rennes (IGDR), UMR 6290 CNRS - University of Rennes 1
Exploring mitochondrial functions and their interplay with the cell cycle: from super-resolution microscopy to FRET biosensors.
Mitochondria are signaling hubs key for cell physiology, and mitochondrial dysfunctions are often retrieved in multifaceted disorders such as cancer and neurodegenerative diseases. At the molecular level, mitochondria are perfectly integrated with other subcellular compartments and machineries. For instance, functions such as mitochondrial morphology and ATP productions were reported to change according to the cell cycle phase of the cell. However, our view on how the cell cycle machinery can directly shape mitochondrial activities is still fragmentary.
In my talk, I will cover how the cell cycle protein Aurora kinase A/AURKA directly impacts mitochondrial morphology, the turnover of defective mitochondria by mitophagy and mitochondrial ATP production by interacting with key organelle substrates. These findings benefited from a wide range of quantitative fluorescence microscopy approaches, spanning from super-resolution microscopy to the use of a custom-made FRET biosensor sensing AURKA activation.
Then, I will showcase how our pipelines to build and analyze the output of genetically-encoded fluorescent probes allowed us to develop the LC3B FRET biosensor, a novel tool to follow autophagy with an unprecedented spatiotemporal precision. With this tool, we elucidated the impact of the cell cycle protein CDK1 in regulating autophagy.
Together, I will highlight how the use of fluorescence microscopy paves the way for a better understanding of mitochondrial functions, and show how the cell cycle is a key element regulating the multiple activities of this organelle.
La pharmacogénétique dans le traitement de la colite ulcéreuse : un modèle de découverte et d’application clinique
Le 2 juin 2023
Date : vendredi 02 juin 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 13h (attention : horaire inhabituel)
Karine TREMBLAY
Laboratoires : Département de pharmacologie-physiologie, Faculté de médecine et des sciences de la santé, Université de Sherbrooke, Site Saguenay (Chicoutimi, QC, Canada), Laboratoire de recherche et transfert en pharmacogénétique
La pharmacogénétique dans le traitement de la colite ulcéreuse : un modèle de découverte et d’application clinique
Les intérêts de recherche de la Pre Tremblay sont orientés sur l'étude des variants génétiques de la réponse aux médicaments ainsi que sur le transfert des connaissances acquises en pratiques cliniques communautaires (en soins primaires ou en cliniques spécialisées) pour le bénéfice des cliniciens et des patients. Le but étant de favoriser le développement d'outils efficaces qui permettront le déploiement des promesses de la médecine de précision de demain. Que ce soit en diminuant le temps nécessaire pour identifier la dose optimale ou éviter les effets indésirables, les individus et la société en retireront un bénéfice concret. Plusieurs projets sont en cours dans son laboratoire. Lors de la conférence, elle présentera un survol de sa programmation de recherche et mettra en lumière son projet de recherche sur l’étude des déterminants pharmacogénétiques de la colite ulcéreuse.
Présentation de la SFR QuaSaV, Qualité et Santé du Végétal et des unités de la SFR
Le 26 mai 2023
Date : Vendredi 26 mai 2023
Lieu : RDC IRIS1 - IBS Horaire : 12h
Fabrice Foucher, Valérie Raymond et Pascal Poupard
Présentation de la SFR QuaSaV, Qualité et Santé du Végétal et des unités de la SFR
- Axes de recherche
- Plateaux mutualisés et plateformes
- Animation scientifique
- Unités de recherche membres de la SFR.
A la marge des sciences institutionnelles, philosophie et anthropologie de l'éthique du mouvement de biohacking en France
Le 5 mai 2023
Date : vendredi 05 mai 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 12h
Guillaume Bagnolini (Docteur en philosophie des sciences)
Laboratoires : Laboratoire Interdisciplinaire Sciences Innovations Sociétés (LISIS), Université Paris-Est Marne-la-Vallée
A la marge des sciences institutionnelles, philosophie et anthropologie de l'éthique du mouvement de biohacking en France
Le biohacking est une vive critique contre les institutions scientifiques officielles et un appel à plus de liberté à travers notamment la constitution de laboratoires citoyens « indépendants », les biohackerspaces. Mon étude philosophique et anthropologique s’est basée essentiellement sur un laboratoire citoyen, la Myne à Lyon. Après une partie historique décrivant et analysant les influences épistémologiques dont s’inspire le biohacking, je me suis posé plusieurs questions : en quoi la pratique du bricolage technique et scientifique réalisée dans ces espaces, amène à construire de « nouvelles » normes et valeurs morales ? Comment se construit l’éthique collective au sein d’un espace tel que la Myne ? Comment les valeurs morales défendues sont opérationnalisées sur le terrain ? Comment s’articule la construction d’une éthique collective avec l’ensemble des éthiques individuelles au cours du temps ? L’objectif de ce travail, à travers l’analyse critique de ce mouvement, est de conduire à une réflexion plus large sur la participation citoyenne dans les choix technoscientifiques et sur les politiques de production scientifique et technique.
Combining flow cytometry & particle analysis to meet the challenges of the nano-scale
Le 29 mars 2023
Date : mercredi 29 mars 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 12h
Natalia Gebara (Application Scientist) 
Laboratoires : société NanoFCM
Combining flow cytometry & particle analysis to meet the challenges of the nano-scale
Single particle characterisation has become increasingly relevant for research into particles at the nanoscale, progressing from bulk analysis techniques and Gen-1 particle analysis to comprehensive multi-parameter measurements such as Nano-flow cytometry. Nano-flow utilizes instrumentation specifically designed for Nano-particle analysis allowing for 1000’s of NPs to be characterized per minute both with and without the use of staining techniques. High resolution side scatter detection allows for size and concentration to be determined for all biological particles >40nm, whilst simultaneous fluorescence detection identifies the presence or labelled markers and targets of interest.
This seminar is appropriate for any research group looking to analyse particles at the nanoscale (>40-1000nm). For example, appropriate particle types include EVs, LNPs and viruses/ virus-like particles. Other nanomaterials, such as AuNPs , are also suitable– their greater density means we can detect down to >8nm on side scatter.
Natalia Gebara, PhD
Application Scientist, Natalia.Gebara @ nanofcm.com
Cette présentation est adossée à la réunion scientifique du GO-EV qui se tiendra sur la matinée, mais est bien entendu ouverte à toutes les personnes du site santé qui souhaite y assister. Une démonstration technique de l’appareillage sera donné dans les locaux de PACeM l’après-midi (14h30-16h30) organisé par Catherine Guillet. Si des personnes souhaitent tester des échantillons, merci de les inviter à se rapprocher de Catherine (catherine.guillet @ univ-angers.fr).
Starting the engine of the powerhouse - the role of POLRMT in mitochondrial transcription and beyond
Le 10 mars 2023
Date : vendredi 10 mars 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 12h
Inge Kuhl (Group Leader, Mammalian Mitochondrial Gene Expression and Function in Health and Disease (MATRIX).
Laboratoires : Dep. Biologie Cellulaire, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule, CEA, CNRS, Université Paris-Saclay
Starting the engine of the powerhouse - the role of POLRMT in mitochondrial transcription and beyond
Mitochondria are central hubs for cellular metabolism, coordinating a variety of metabolic reactions crucial for human health. Mitochondria provide most of the cellular energy via their oxidative phosphorylation (OXPHOS) system, which requires the coordinated expression of genes encoded by both the nuclear and mitochondrial genomes (mtDNA). Transcription of mtDNA by the mammalian RNA polymerase (POLRMT) is not only essential for the biogenesis of the OXPHOS system, but also generates RNA primers necessary to initiate mtDNA replication, placing this enzyme at the heart of both, mtDNA expression and replication. We previously showed that POLRMT levels play a role in balancing mtDNA replication and transcription, and elevated POLRMT levels were found in several cancers. We recently generated and characterized a mouse over-expressing Polrmt to investigate the physiological and molecular consequences of elevated POLRMT levels in non-pathogenic conditions. I will present our past and current research on the in vivo regulatory role of POLRMT in health and disease.
Le centre de référence en France pour toutes questions relatives aux 3R
Le 24 février 2023
Date : Vendredi 24 février 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 12h
Susana Gomez
Laboratoire : FC3R
Le centre de référence en France pour toutes questions relatives aux 3R
Formation continue autour des 3R (Remplacement, Réduction et Raffinement), principe qui permet de fixer les lignes de conduite pour l’utilisation éthique d’animaux à des fins scientifiques. Le GIS FC3R a pour objectif de fédérer tous les acteurs de la recherche (EPST, Universités, Industries) pour guider au mieux les recherches afin d’en augmenter la qualité, et de promouvoir des méthodes substitutives, responsables et innovantes.
Évaluation de la douleur : Un compromis adapté et réfléchi entre Sciences et bien-être animal
Le 10 février 2023
Date : Vendredi 10 février 2023
Lieu : Amphithéâtre ICO Horaire : 12h
Sébastien Paturance (chargé de mission CNRS)
Laboratoires : CNRS
Évaluation de la douleur : Un compromis adapté et réfléchi entre Sciences et bien-être animal
La douleur et son évaluation sont deux paramètres expérimentaux à prendre en compte lors de la rédaction d’une demande d’autorisation de projet mais aussi lors de la réalisation des procédures.
Ce n’est pas exercice simple en soi du fait de la difficulté à déterminer le niveau de souffrance d’un animal. Quel moyen mettre en place ? Est-ce que cela est variable en fonction des modèles ? faut-il arrêter la procédure ? éliminer certains individus ? les résultats scientifiques seront ils pertinent ? et au niveau statistiques ? Que de questions à se poser et réfléchir en amont de la mise en œuvre de votre projet scientifique de manière à anticiper tous ces points.
Cette présentation d’une heure a pour but de vous amener à vous poser les questionnements sur la douleur potentielle générer lors de vos expérimentations, de la prendre en compte sans que vos résultats soient compromis ! des réponses à ces questionnements seront abordées et une discussion à l’issu de la présentation sera ouverte afin d’aborder les cas spécifiques que vous pouvez avoir.
Save the date
- 15 février : Amy VINCENT invitée par MitoVasc - MitoLab
- 19 mars (matinée suivie d’un cocktail) : Séminaire commun Confluences ICAT
- 22 mars : Oksana KRUPKA de MINT
- 12 avril : Kévin LE DIVELLEC invité par MINT
- 17 mai: François GUILLONNEAU invité par la SFR ICAT
- 28 juin : Danielle ARRUDA invitée par GLIAD
- 5 juillet : Alexandre CECALDI invité pour le Workshop Nanomed
